Der Alpen-Mauerpfeffer kommt nicht nur in den Alpen, sondern auch in anderen Hoch- und Mittelgebirgen Europas vor: den Pyrenäen, Vogesen, Apennin, Insel Korsika und in den Karpaten. Er siedelt sich vor allem in Höhenlagen zwischen 1000 und mehr als 3000m ü. NN an, allerdings nur auf kalkfreiem, silikathaltigem Boden.
Der Alpen-Mauerpfeffer ist eine mehrjährige, kleine Staude, die lockere Rasen bildet. Sie hat bogig aufsteigende Stängel, die aber nicht höher werden als 8cm und Blüten tragen neben dichtbeblätterten Trieben ohne Blüten. Die dickfleischigen kleinen Laubblätter habe eine zylindrische bis keulenartig verdicket Form. Sie sind grau-grün gefärbt und können manchmal auch rot überlaufen sein. Sie sitzen direkt an den Trieben und Stängeln an und sind wechselständig angeordnet. Jeweils einige wenige der gelben Blüten bilden einen gemeinsamen Blütenstand. Die Blüten haben kurze Stiele und 5-zähilge Kronblätter. Die Blütenkrone hat einen Durchmesser von etwa 5 bis 8mm. Blütezeit sind die Monate Juni bis August.